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Formations

DU Spectrométrie de masse

  • Durée: 126 h dont 54 h en enseignement à distance
  • Accessible en: Formation initiale, Formation continue
  • Langue(s) d'enseignement: Français
  • Niveau de diplôme requis à l'entrée: Bac + 2 scientifique minimum
  • Niveau de diplôme validé à la sortie: Diplôme universitaire
  • Date de publication : 12-06-2023

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Objectifs de la formation

À l’issue de cette formation, vous aurez acquis les connaissances nécessaires en spectrométrie de masse (MS) pour :

  • Maîtriser le fonctionnement des instruments tant sur le plan de la compréhension théorique que de la mise en œuvre pratique ;
  • acquérir une solide connaissance du fonctionnement de la technologie MS et de l’interprétation des données produites ;
  • travailler sur des échantillons complexes sans avoir à les purifier ;
  • identifier la meilleure stratégie analytique à adapter et déterminer l’instrument le plus approprié pour répondre à une problématique donnée ;
  • identifier et adapter la meilleure stratégie en fonction des besoins (identification, quantification, …) ;
  • connaître le fonctionnement de ces instruments et adapter la préparation d’échantillons de manière adéquate ;
  • savoir traiter les données et les interpréter ;
  • et de façon générale, mettre en application une technique expérimentale, de la préparation des échantillons à l’analyse des résultats ;
  • adapter le couplage de la MS avec une/des techniques séparatives (techniques chromatographiques et électrophorétiques) et mettre en œuvre un mode opératoire en fonction des caractéristiques de leur échantillon ;
  • développer des compétences dans les champs de la préparation des échantillons (techniques d’extraction, de purification…) et de l’analyse par MS.

Spécificités de la formation

Pédagogie innovante mise en place pour la partie socle théorique

Les enseignements y seront proposés sous forme d’un Small Private Online Course (SPOC). Il s’organisera sous forme de cours en ligne privés en petits groupes.
La partie spécialité « Biologie & Clinique » proposée en présentiel sera composée de cours, travaux dirigés et travaux pratiques en laboratoires sous forme d’ateliers de recherche allant de la préparation d’échantillons à l’analyse des données.
Visite des laboratoires du Centre de Biologie Pathologie Génétique du CHU de Lille

Matériels utilisés

  • Matériels disponibles à la faculté de Pharmacie :

    • HPLC couplée à un Q-trap
    • UHPLC couplé à un triple quadripôle
    • UHPLC couplé à un orbitrap
    • Électrophorèse capillaire couplée à un triple quadripôle

  •  Matériels disponibles à la faculté des Sciences et technologies :

    • Spectromètres de masse MALDI-TOF Ultraflex II etRapiflex
    • Spectromètre de masse MALDI-LTQ-orbitrap
    • Spectromètres de masse de type ESI-Q-Exactive
    • Spectromètres de masse ESI-QTOF avec mobilité d’ions
    • NanoUHPLC et nanoLC en couplage
    • Robots de préparation pour l’imagerie MALDI MS
    • Spectromètre de masse Tof-SIMS

Composante portant le DU :  Département Biologie - Faculté des Sciences et Technologies

Compétences visées

  • Comprendre le fonctionnement de la technologie MS et ses capacités.
  • Savoir adapter la stratégie analytique et l’instrument à une problématique.
  • Savoir adapter la préparation de l’échantillon à l’instrument utilisé.
  • Maîtriser le fonctionnement des instruments tant sur le plan de la compréhension théorique que de la mise en œuvre pratique.
  • Savoir traiter les données recueillies.
  • Savoir interpréter les données.
  • Savoir remettre les données dans la problématique de départ.
  • Se mettre en situation de trouver le meilleur schéma analytique à partir d’une problématique inconnue.

Pré-requis

  • Connaissances de base en techniques analytiques et notions de spectrométrie de masse.
  • Bac + 2 scientifique minimum, en chimie, biochimie, physique, biologie, pharmacie, médecine ou SPI exigé ou justifier d’une expérience professionnelle équivalente dans un domaine scientifique (2 ans minimum)
  • Maîtrise de l’anglais recommandée (lecture/compréhension de documents scientifiques)

Modalités d'admission/Conditions d'accès

Public

Salariés ou demandeurs d’emploi, ingénieurs, chercheurs ou techniciens supérieurs souhaitant développer une « expertise » dans un ou plusieurs champs d’application de la MS  et mettre en application une technique expérimentale, de la préparation des échantillons à l’analyse des résultats.

Sélection

Les candidats constitueront un dossier contenant :

  • un curriculum vitae détaillant leur formation et leur parcours professionnel ;
  • une lettre de motivation indiquant leur intérêt pour ce DU, dans le cadre de leur projet professionnel.

Programme

Organisation de la formation

Le DU spectrométrie de masse est une formation d’une durée de 126 heures d’enseignements au total. Il est organisé autour de 3 blocs de connaissances et de compétences (BCC). Chaque BCC est composé d’une unité d’enseignement (UE) et chaque UE est composée d’éléments constitutifs (EC)

  • BCC1 et BCC2 : Socle théorique de 54 heures à distance sous forme de SPOC pour les cours et TD. Il sera proposé à partir de supports rédigés en français et/ou en anglais ;
  • BCC3 : Module de spécialité « Biologie et Clinique » de 72 heures en présentiel, concentré sur une durée de 2 semaines consécutives.

Contenu

BCC1. Maîtriser les principes de la spectrométrie de masse (CM 24H et TD 3H)

  • UE MS1. La spectrométrie de masse: principe et appareillage
    • EC1. Les bases de la spectrométrie de masse
    • EC2. Sources de production d'ions
    • EC3. Analyseurs de masse
    • EC4. Méthodes séparatives et couplages

BCC2. Savoir interpréter les données de spectrométrie de masse (CM 16H et TD 11H)

  • UE MS2. Production de données de spectrométrie de masse
    • EC1. Interprétation de spectres MS
    • EC2. Spectrométrie de masse en tandem
    • EC3. Quantification par spectrométrie de masse

BCC3. Conduire un projet en spectrométrie de masse pour la biologie et la clinique (CM 25H, TD 12H et TP 35H)

  • UE MS3. Spécialisation méthodologique
    • EC1. Introduction aux données de omiques
    • EC2. Analyse de surfaces et imagerie
    • EC3. Analyse des données statistiques
    • EC4. Ateliers pratiques en laboratoires

Modalités d'évaluation

  • Socle théorique à distance
    Avant la fin du socle théorique, une première évaluation blanche sera proposée afin de situer le niveau de chaque participant. À la suite de cette évaluation blanche et en fonction des résultats, 1 à 2 classes virtuelles pourront être organisées afin de revoir les notions non encore acquises.

L’examen du socle théorique sera réalisé en même temps que l’évaluation de la spécialité par une épreuve sur table.

  • Spécialité
    Évaluation de la théorie (socle commun + spécialité) en fin de première semaine de formation : examen écrit sur table d’une durée de 2 heures.
    Évaluation de la pratique au fur et à mesure des manipulations
    Un projet sera à développer et sera finalisé par une soutenance orale.

Les participants développeront une expertise dans le domaine de la spectrométrie de masse allant de la préparation des échantillons à l’acquisition des données. Ils acquerront une solide connaissance de la technologie notamment sur le fonctionnement des instruments tant sur le plan de la compréhension théorique que de la mise en œuvre pratique qui est indispensable pour développer des stratégies analytiques en fonction des besoins (identification, quantification…).

Les participants développeront de solides connaissances sur l’interprétation et l’utilisation des données dans une problématique. A l’issue de cette formation, les participants élargiront leur domaine de compétence en science analytique et plus particulièrement en spectrométrie de masse qui est un aujourd’hui un outil indispensable pour l’analyse d’échantillons purs ou complexes. Ils pourront ainsi mieux répondre au marché de l’emploi et prétendre à de nouveaux emplois qui étaient hors de leur domaine de compétence ou alors se perfectionner dans leur métier et s’adapter aux contraintes et exigences de leur employeur.

Contacts administratifs

Secrétariat Formation continue et alternance
fst-fcauniv-lillrfr

Secrétariat pédagogique

Monique MARTI
monique.martiuniv-lillefr

Responsable de la formation

Julien FRANCK, maître de conférences
Département de biologie, FST Laboratoire Prism,
03 20 43 40 56
julien.franckuniv-lillefr

Dates, horaires, lieu, tarifs

Composante portant le DU :  Département Biologie -  Faculté des Sciences et Technologies